MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl23

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011257	TTAA	2	8	36	43	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011257	AT	3	6	96	101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011257	CAC	2	6	112	117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011257	T	6	6	127	132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011257	T	9	9	134	142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011257	TAA	2	6	160	165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011257	TAA	2	6	197	202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011257	TAAATA	2	12	236	247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011257	ATTTA	2	10	284	293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011257	TGA	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011257	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011257	TA	4	8	442	449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011257	T	6	6	467	472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011257	AT	3	6	473	478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011257	ATT	2	6	501	506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011257	ATT	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011257	TTAC	2	8	590	597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011257	AAG	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011257	TCA	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011257	ATT	2	6	946	951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011257	TAAT	2	8	961	968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011257	TAA	2	6	982	987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011257	ATTT	2	8	1001	1008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011257	TAAAA	2	10	1034	1043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011257	GAA	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011257	A	6	6	1080	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011257	A	7	7	1091	1097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011257	AAAT	2	8	1106	1113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011257	ATAG	2	8	1135	1142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011257	ATTT	2	8	1181	1188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011257	TTG	2	6	1217	1222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011257	TAA	2	6	1229	1234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011257	T	6	6	1245	1250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011257	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011257	ACA	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011257	AAT	2	6	2303	2308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011257	TAC	2	6	2317	2322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011257	A	7	7	2337	2343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011257	TA	3	6	2358	2363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011257	TA	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011257	AT	3	6	2387	2392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011257	AAATT	2	10	2401	2410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011257	TCA	2	6	2411	2416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011257	TA	3	6	2417	2422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011257	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011257	ATA	2	6	2505	2510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011257	ATT	2	6	4024	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011257	TCG	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011257	AGA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011257	AC	3	6	4070	4075	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011257	ATTA	2	8	4097	4104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011257	TGA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011257	A	6	6	4125	4130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011257	AC	3	6	4179	4184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011257	TAA	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011257	CAC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011257	TATAA	2	10	4276	4285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011257	ATT	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011257	ATCTT	2	10	4341	4350	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011257	TAT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011257	TAA	2	6	4484	4489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011257	ATG	2	6	4526	4531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011257	T	6	6	4542	4547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011257	AC	3	6	4557	4562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011257	TAAA	2	8	4585	4592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011257	A	6	6	4590	4595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011257	TAAT	2	8	4596	4603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011257	AAT	2	6	4664	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011257	ATT	2	6	4698	4703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011257	TTA	2	6	4709	4714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011257	ATTCA	2	10	4725	4734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011257	AAC	2	6	4753	4758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011257	ACT	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011257	ACA	2	6	4793	4798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011257	A	7	7	4820	4826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011257	CAA	2	6	4827	4832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011257	TAT	2	6	4853	4858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011257	ATC	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011257	TAAT	2	8	4897	4904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011257	TAA	2	6	4936	4941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011257	A	7	7	4940	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011257	TTA	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011257	AAT	2	6	4959	4964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011257	ATA	2	6	5004	5009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011257	A	7	7	5009	5015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011257	ATCA	2	8	5041	5048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011257	TTAGC	2	10	5073	5082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011257	TCC	2	6	6450	6455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011257	AAAATT	2	12	6476	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011257	A	6	6	6522	6527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011257	A	9	9	6529	6537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011257	TA	3	6	6550	6555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011257	TAT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011257	TA	3	6	7042	7047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011257	AATTA	2	10	7574	7583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011257	TAT	2	6	7584	7589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011257	AAC	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011257	TCA	2	6	8913	8918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011257	TAAA	2	8	8927	8934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011257	ATA	2	6	8951	8956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011257	AATC	2	8	8966	8973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011257	TAT	2	6	10257	10262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011257	ATTA	2	8	10280	10287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011257	AATT	2	8	10288	10295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011257	ATTGA	2	10	10323	10332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011257	A	7	7	10337	10343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011257	A	6	6	10460	10465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011257	ATT	2	6	10498	10503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011257	TAA	2	6	10532	10537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011257	GATA	2	8	10538	10545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011257	TTA	2	6	10553	10558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011257	A	6	6	10677	10682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011257	ATA	2	6	10684	10689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011257	TA	3	6	10698	10703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011257	AT	3	6	10719	10724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011257	AAC	2	6	10727	10732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011257	AAT	2	6	10745	10750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011257	A	6	6	10761	10766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011257	CATA	2	8	10779	10786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011257	AT	3	6	10829	10834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011257	TCA	2	6	10860	10865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011257	ACA	2	6	10898	10903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011257	ATTT	2	8	10961	10968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011257	AAT	2	6	11000	11005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011257	TAA	2	6	11035	11040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011257	AGGG	2	8	11048	11055	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011257	A	6	6	12696	12701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011257	GA	3	6	12721	12726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011257	ATT	2	6	12730	12735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011257	ACT	2	6	12740	12745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011257	AGG	2	6	12764	12769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011257	A	7	7	13534	13540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011257	TAAA	2	8	13543	13550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011257	CTT	2	6	13576	13581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011257	ATA	2	6	14957	14962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011257	AAT	2	6	14983	14988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011257	TAT	2	6	14992	14997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011257	AT	3	6	14996	15001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011257	TATCT	2	10	15695	15704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011257	TAA	2	6	15705	15710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011257	AC	4	8	15712	15719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011257	TCA	2	6	15754	15759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011257	ATG	3	9	15782	15790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011257	TAA	4	12	15805	15816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011257	ACTTT	2	10	15853	15862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011257	TTAA	2	8	15873	15880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011257	AT	3	6	16879	16884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011257	GAA	2	6	16887	16892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011257	TAT	2	6	18839	18844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011257	TAAT	2	8	18847	18854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011257	AT	3	6	18869	18874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011257	TTTA	2	8	18881	18888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011257	TAA	2	6	18894	18899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011257	A	6	6	18913	18918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011257	A	9	9	18927	18935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011257	AAT	2	6	18999	19004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011257	TCC	2	6	19761	19766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_011257	TAA	2	6	19859	19864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011257	A	6	6	19869	19874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011257	ATT	2	6	19893	19898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_011257	T	7	7	20357	20363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011257	ATT	2	6	20384	20389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_011257	A	6	6	20423	20428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_011257	AAT	2	6	21763	21768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011257	AAT	2	6	21775	21780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_011257	ATA	2	6	21782	21787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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206	NC_011257	TTTA	2	8	22133	22140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_011257	TCAT	2	8	22165	22172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
209	NC_011257	T	7	7	22189	22195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_011257	GGAAG	2	10	22310	22319	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.